โรงเรียนปอเนาะเกิดขึ้นในช่วง ๒๔๗๖ หลังจากการเปลี่ยนแปลงการปกครองและเกิดรัฐประหารครั้งแรก ด้วยหะยีสุหลงกลับมาจากเมกกะเห็นอิสลามปัตตานีปฏิบัติผิดหลักศาสนาและยังเชื่อภูตผีปีศาจจึงหาทุนสร้างรร.สอนศาสนาและ”พยาพหลพลพยุหเสนา”ให้ทุนเพิ่มจึงเกิดโรงเรียนปอเนาะเป็นแห่งแรกที่ปัตตานี